24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1332 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1439    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  38.41 
 
 		 856 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  36.55 
 
 		 308 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  34.04 
 
 		 347 aa  95.5  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  34.76 
 
 		 231 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  33.51 
 
 		 246 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  31.56 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  32.17 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  32.98 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  34.01 
 
 		 205 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  38.3 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  29.47 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  32.26 
 
 		 281 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  29.63 
 
 		 282 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  29.41 
 
 		 524 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  28.26 
 
 		 239 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  25.6 
 
 		 596 aa  50.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  32.5 
 
 		 235 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  31.85 
 
 		 609 aa  43.9  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>