22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4173 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0999993 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6807  hypothetical protein  39.75 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2326  hypothetical protein  35.35 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0830351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2659  hypothetical protein  31.02 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  33.05 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6166  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  42.86 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00855701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0350  sex pilus assembly and mating pair formation protein  39.39 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.448166 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  29.73 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3999  hypothetical protein  32.76 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4297  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.654961 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  34.94 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  31.06 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3771  hypothetical protein  28 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  34.58 
 
 		 431 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  25 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6231  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0248  hypothetical protein  25.55 
 
 		 328 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>