22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0600 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  361  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  98.91 
 
 		 184 aa  357  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  71.43 
 
 		 186 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  69.51 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  64.5 
 
 		 184 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  68.29 
 
 		 171 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  66.87 
 
 		 183 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  63.25 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  53.64 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  59.54 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  68 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  52.04 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  46.53 
 
 		 247 aa  88.6  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  45 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  39.58 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  34.18 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  29.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  28.71 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>