236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1996 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1996  Rhodanese domain protein  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1994  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  91.38 
 
 
286 aa  208  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  47.62 
 
 
275 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  50.49 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.76 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.02 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  47 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  46.08 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  44.66 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  49.02 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  47.12 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  47.57 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  47.52 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.54 
 
 
627 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  40.71 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  40.95 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  48.54 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1199  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000276254  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  49.51 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  43.27 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.88 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.46 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  48 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 
285 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45 
 
 
282 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.52 
 
 
285 aa  72  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.44 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  43 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.75 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  41.58 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.45 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.19 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.75 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.44 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.62 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  39.58 
 
 
687 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  35 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  40.57 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  35 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.1 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  40 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  39.39 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.98 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.59 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.98 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  42.22 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  30.25 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11880  rhodanese-related sulfurtransferase  42.16 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.808545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.59 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  40.23 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.59 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  40.23 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  44.19 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  35 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  33.64 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.4 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  45.83 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  45.83 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>