More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1003 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  100 
 
 
444 aa  859    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  42.02 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  43.38 
 
 
493 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  41.03 
 
 
460 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  41.57 
 
 
468 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.41 
 
 
924 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  44.2 
 
 
933 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  40.09 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  43.41 
 
 
459 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  42.56 
 
 
470 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.53 
 
 
954 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  42.56 
 
 
470 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  42.56 
 
 
470 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  38.42 
 
 
426 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.42 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  42.96 
 
 
496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  38.72 
 
 
469 aa  273  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  42.35 
 
 
459 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  42.05 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  43.9 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  40.22 
 
 
563 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  42.48 
 
 
517 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  46.77 
 
 
457 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.48 
 
 
441 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  43.85 
 
 
463 aa  262  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  38.67 
 
 
470 aa  262  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  42.82 
 
 
476 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  44.35 
 
 
921 aa  256  5e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  41.18 
 
 
533 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  42.49 
 
 
405 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  45.36 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  39.01 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  37.65 
 
 
529 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  37.85 
 
 
517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  37.21 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  38.02 
 
 
462 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  37.5 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  41.75 
 
 
543 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  39.63 
 
 
475 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  43.08 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  38.85 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.65 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  39.39 
 
 
472 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  35.76 
 
 
659 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  38.4 
 
 
439 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37 
 
 
493 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  36.01 
 
 
463 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  35.99 
 
 
422 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  35.83 
 
 
414 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  37.56 
 
 
487 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  38.65 
 
 
519 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  34.17 
 
 
409 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  42.12 
 
 
494 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  34.89 
 
 
399 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.55 
 
 
422 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.89 
 
 
409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  38.03 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  35.99 
 
 
428 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.73 
 
 
463 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  35.62 
 
 
481 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  38.8 
 
 
443 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  36.36 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  36.76 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  35.22 
 
 
972 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.73 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.8 
 
 
368 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  32 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  35.36 
 
 
374 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  37.68 
 
 
364 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1494  cell cycle protein  38.98 
 
 
382 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00473768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  35.61 
 
 
420 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  33.03 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  34.93 
 
 
395 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  36.3 
 
 
423 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  33.33 
 
 
509 aa  152  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  34.17 
 
 
354 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  34.55 
 
 
370 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  35.89 
 
 
369 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.21 
 
 
367 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  36.08 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  37.14 
 
 
368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.1 
 
 
359 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  33.69 
 
 
365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  34.95 
 
 
364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  33.33 
 
 
391 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  35.82 
 
 
424 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  33.33 
 
 
391 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4569  cell division protein FtsW  34.93 
 
 
418 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.35 
 
 
371 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08840  cell division membrane protein  36.92 
 
 
479 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  34.18 
 
 
413 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  34.82 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  33.77 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  32.03 
 
 
365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  35.48 
 
 
530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3469  cell division protein FtsW  34.12 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597104  normal  0.0182976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  33.77 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  33.53 
 
 
427 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  31.54 
 
 
375 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  35.45 
 
 
474 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>