More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0960 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0960  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 		 336 aa  674    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.257162  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  56.95 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  55.59 
 
 		 332 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.11 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  54.05 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.83 
 
 		 348 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.9 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  52.98 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  52.17 
 
 		 335 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  55.25 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  53.31 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  50.93 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.91 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  53.9 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  53.9 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  53.9 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  46.6 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.33 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.32 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.96 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  44.81 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  41.42 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.58 
 
 		 304 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.07 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  39.3 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.75 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  38.66 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  44.38 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.82 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  43.75 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  38.66 
 
 		 304 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  41.98 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.68 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  41.31 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  41.88 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.44 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.78 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  40.38 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.92 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40.27 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.59 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  39.74 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  39.27 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  39.27 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.87 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.44 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  39.53 
 
 		 320 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  40.72 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  39.26 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.14 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  37.03 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  37.81 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  41.28 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  36.96 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  36.97 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  37.11 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.47 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.78 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  38.29 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.82 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.03 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  38.93 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  34.88 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  43.45 
 
 		 304 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  38.93 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  41.02 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.35 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  39.87 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  40.69 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.46 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  39.49 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.59 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  37.59 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.1 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  41.84 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  40.19 
 
 		 322 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.61 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  43.27 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.83 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.19 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.14 
 
 		 311 aa  196  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  36.24 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  42.37 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  41.16 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  35.99 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  39.42 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  38.91 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  36.54 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  36.88 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.67 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  36.94 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  35.97 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  39.73 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  41.28 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  42.47 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.6 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  38.26 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.66 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.51 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>