243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0101 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0101  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
772 aa  1544    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.143476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 
929 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 
929 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.41 
 
 
947 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.89 
 
 
938 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.84 
 
 
939 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.1 
 
 
957 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.51 
 
 
929 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.47 
 
 
946 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 
906 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.8 
 
 
933 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 
932 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 
926 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 
926 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.41 
 
 
995 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.89 
 
 
997 aa  392  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 
994 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
952 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
937 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.14 
 
 
1002 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.74 
 
 
929 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 
1007 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.12 
 
 
931 aa  382  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.23 
 
 
884 aa  382  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 
938 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 
914 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.53 
 
 
954 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 
972 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
920 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 
896 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 
989 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.4 
 
 
981 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.87 
 
 
1023 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.84 
 
 
989 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.01 
 
 
989 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.38 
 
 
989 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.41 
 
 
1018 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 
928 aa  364  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 
940 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 
890 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 
946 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 
946 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 
946 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 
889 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
903 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 
928 aa  360  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 
915 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.58 
 
 
937 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 
933 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.3 
 
 
938 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.79 
 
 
907 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.24 
 
 
879 aa  357  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 
1001 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 
950 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.98 
 
 
951 aa  356  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
985 aa  355  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.3 
 
 
954 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.92 
 
 
1021 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.07 
 
 
945 aa  354  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 
1002 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 
1004 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 
1008 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 
994 aa  350  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.53 
 
 
929 aa  350  7e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 
1009 aa  349  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.45 
 
 
1017 aa  349  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
937 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 
1009 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.44 
 
 
1030 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 
929 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 
949 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 
1075 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 
908 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 
910 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.13 
 
 
929 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.84 
 
 
900 aa  347  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 
1009 aa  347  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.09 
 
 
932 aa  347  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 
998 aa  347  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 
998 aa  347  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.31 
 
 
910 aa  347  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 
1088 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.24 
 
 
1017 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.43 
 
 
1024 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 
970 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 
936 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.43 
 
 
1024 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.41 
 
 
1038 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.18 
 
 
926 aa  343  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 
929 aa  343  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.89 
 
 
982 aa  343  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 
908 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 
923 aa  342  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.46 
 
 
936 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3418  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 
881 aa  341  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 
994 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.06 
 
 
892 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 
994 aa  340  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.07 
 
 
940 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>