27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0738 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  100 
 
 
309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0775  HhH-GPD family protein  95.79 
 
 
309 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0783  HhH-GPD family protein  75.08 
 
 
325 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.4 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.09 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.3 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  26.8 
 
 
234 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.95 
 
 
297 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
523 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.9 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  24.05 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.05 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.38 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  25 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  27.87 
 
 
202 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24680  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  36.3 
 
 
536 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.85 
 
 
288 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.48 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.69 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.12 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.52 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.74 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  26.92 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2795  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.74 
 
 
453 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  30 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  25 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.81 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>