296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1090 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.82 
 
 
286 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.64 
 
 
290 aa  275  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.15 
 
 
287 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.16 
 
 
286 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.1 
 
 
291 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  46.34 
 
 
291 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.96 
 
 
292 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.07 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.07 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  41.44 
 
 
310 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.57 
 
 
291 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.69 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.36 
 
 
285 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
290 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  41.67 
 
 
299 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.01 
 
 
288 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
306 aa  234  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.82 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.1 
 
 
290 aa  227  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  42.47 
 
 
308 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.53 
 
 
275 aa  224  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
287 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.61 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.96 
 
 
652 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.28 
 
 
289 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.78 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.73 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 
282 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.84 
 
 
267 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.39 
 
 
296 aa  205  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.01 
 
 
289 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
287 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  38.95 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  40.3 
 
 
293 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.52 
 
 
292 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.46 
 
 
282 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.06 
 
 
288 aa  158  7e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.15 
 
 
283 aa  155  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
293 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.04 
 
 
278 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.14 
 
 
285 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 
287 aa  148  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 
288 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.05 
 
 
281 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.64 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.42 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
284 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.34 
 
 
284 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
289 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
282 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  32.69 
 
 
292 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.41 
 
 
291 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
283 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
282 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
288 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
285 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  30.74 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.97 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  30.98 
 
 
282 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
301 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  30.5 
 
 
280 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  31.16 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 
290 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 
286 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 
286 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.11 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2963  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.16 
 
 
100 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0756667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1711  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  43.86 
 
 
89 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
1016 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  23.34 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0202  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  48.08 
 
 
86 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1528  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  43.1 
 
 
89 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0377  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  38.98 
 
 
89 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  24.83 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.51 
 
 
84 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.246621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.02 
 
 
381 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  23.83 
 
 
416 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2393  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  48.08 
 
 
87 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.779105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0261  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  41.79 
 
 
92 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2172  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40.35 
 
 
88 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  24.48 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2242  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.28 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193529  normal  0.0185551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0725  pyruvic-ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.31 
 
 
86 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.976921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.66 
 
 
437 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.03 
 
 
260 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  36.36 
 
 
444 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2719  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  47.17 
 
 
81 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.73 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  36.36 
 
 
435 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.5 
 
 
438 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.96 
 
 
436 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.59 
 
 
360 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1862  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.36 
 
 
107 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0417401  normal  0.959397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>