More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1653 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1653  ribonuclease H  100 
 
 		 160 aa  323  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3267  ribonuclease H  75.89 
 
 		 169 aa  203  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  65.28 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  60.29 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  57.14 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  60.28 
 
 		 153 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  59.56 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  60.99 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  60.9 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  60.9 
 
 		 154 aa  173  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  58.96 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  61.48 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  56.43 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  59.7 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  56.43 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  60.14 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  55.71 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  59.56 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  57.89 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  57.14 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  60.14 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  55.24 
 
 		 149 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  55.4 
 
 		 148 aa  170  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  59.85 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  57.78 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  55.71 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  57.78 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  55.71 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  55.71 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  54.68 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  59.56 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  56.34 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  56.3 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  54.61 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  54.61 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  59.4 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  57.34 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  53.57 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  58.65 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  52.82 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  55.71 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  57.89 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  56.34 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  58.65 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  56.3 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  56.3 
 
 		 148 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  54.79 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  56.39 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  56.39 
 
 		 153 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  50 
 
 		 155 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  57.14 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  52.41 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  53.52 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  55 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  56.82 
 
 		 142 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  54.68 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  54.29 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  54.29 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  53.1 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  55.94 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  55.47 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  49.33 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.72 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  55.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  55.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  55.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  53.57 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  55.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  55 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  55.15 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4730  ribonuclease H  58.74 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  55.71 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  56.43 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4350  ribonuclease H  58.74 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  51.35 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4436  ribonuclease H  58.74 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50.69 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  54.55 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  56.72 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  55.97 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  56.2 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  52.86 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  53.28 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  54.89 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  54.55 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>