34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2916 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  771    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1080  hypothetical protein  33.06 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0414102  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
724 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  36.28 
 
 
717 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  42.16 
 
 
592 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  32.58 
 
 
950 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 
835 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  42.86 
 
 
691 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
835 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
721 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1841  hypothetical protein  27.66 
 
 
796 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  39.74 
 
 
1124 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  35.16 
 
 
818 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.14 
 
 
1147 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41 
 
 
1243 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 
593 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  35.29 
 
 
674 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  33.98 
 
 
1151 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 
467 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  32.17 
 
 
868 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.04 
 
 
596 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  44.76 
 
 
1077 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0586  hypothetical protein  32.21 
 
 
568 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  37.5 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39 
 
 
601 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  50 
 
 
1193 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  33.33 
 
 
1131 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 
836 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 
775 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  24.02 
 
 
840 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  28.83 
 
 
1199 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.89 
 
 
835 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  36.08 
 
 
1378 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  35.96 
 
 
884 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>