27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0010 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  100 
 
 
1503 aa  3031    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  62.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.38 
 
 
1141 aa  60.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  47.92 
 
 
288 aa  52.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2660  hypothetical protein  35.16 
 
 
119 aa  52  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  47.06 
 
 
110 aa  51.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  44 
 
 
1153 aa  50.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.86 
 
 
388 aa  49.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1872  hypothetical protein  38.18 
 
 
158 aa  48.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  42.86 
 
 
406 aa  48.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  40.74 
 
 
237 aa  48.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  44 
 
 
340 aa  48.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.18 
 
 
1149 aa  48.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  42 
 
 
380 aa  48.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  40.82 
 
 
351 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4365  hypothetical protein  38.18 
 
 
139 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380391  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
1139 aa  47  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  47  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5893  hypothetical protein  43.14 
 
 
221 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  64.29 
 
 
265 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  39.29 
 
 
330 aa  47  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.63 
 
 
1080 aa  46.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2930  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0125  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.76 
 
 
1081 aa  46.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3289  hypothetical protein  36.54 
 
 
138 aa  45.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  37.74 
 
 
155 aa  45.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>