27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2839 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  25.9 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  28.67 
 
 
173 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  28.29 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  28.29 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1282  hypothetical protein  26.76 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  26.79 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  25.71 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  27.03 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  25.71 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  25.71 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  26.67 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  25.87 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  23.13 
 
 
272 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2704  hypothetical protein  26.98 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.608865  normal  0.0263115 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  26.39 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  26.39 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  26.39 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  26.39 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  33.85 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  25.17 
 
 
153 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>