38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1388 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  228  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  92.08 
 
 		 101 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  92.08 
 
 		 101 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  92.08 
 
 		 101 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  85.15 
 
 		 105 aa  187  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  80.21 
 
 		 107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  76.24 
 
 		 103 aa  160  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  79.79 
 
 		 154 aa  159  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 107 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  34.74 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  27.72 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  36.25 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  31.52 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  25.86 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  36.14 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  27.62 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0198  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  32.04 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  29.25 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4579  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.741474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>