22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05875 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  100 
 
 
358 aa  723    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  66.99 
 
 
356 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  62.62 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  54.7 
 
 
379 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  71.49 
 
 
402 aa  346  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  33.83 
 
 
184 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  33.83 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  33.83 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  37.37 
 
 
180 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  29.81 
 
 
192 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  29.2 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  29.81 
 
 
185 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  29.31 
 
 
182 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  31.25 
 
 
182 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  27.27 
 
 
186 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  27.68 
 
 
180 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  26.37 
 
 
178 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  28.74 
 
 
179 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  29.25 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  27.38 
 
 
189 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  24.7 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>