More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2363 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  58.54 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
85 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
82 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  58.02 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  54.32 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  48.19 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  53.01 
 
 
90 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  50 
 
 
88 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
85 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  56.79 
 
 
85 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  56.79 
 
 
85 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  47.06 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  56.79 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  56.25 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  56.1 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  47.78 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
83 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
83 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  50 
 
 
86 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
83 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
83 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 
103 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  55.56 
 
 
84 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
87 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 
85 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  51.22 
 
 
85 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
85 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  48.78 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  48.78 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  51.76 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  53.66 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
80 aa  84.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
86 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  49.4 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  51.16 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  53.75 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  50.62 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  53.66 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  52.44 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  45.88 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50.62 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  44.94 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  44.83 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  47.5 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  44.83 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  49.4 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>