More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0318 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  234  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  234  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  76.56 
 
 
126 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  74.22 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  68.85 
 
 
126 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  69.29 
 
 
128 aa  139  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
127 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
126 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  66.93 
 
 
127 aa  137  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 
123 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
127 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
122 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
122 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 
125 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  64.57 
 
 
127 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0271  50S ribosomal protein L12P  71.09 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0803416  hitchhiker  0.00134879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  69.53 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
125 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  67.97 
 
 
128 aa  126  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
124 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
125 aa  123  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
123 aa  123  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
125 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
128 aa  123  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
126 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
122 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
121 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
125 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  67.21 
 
 
126 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
124 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
124 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 
125 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
125 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
124 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
125 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
127 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  62.5 
 
 
122 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 
123 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 
124 aa  120  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
124 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
125 aa  120  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
125 aa  120  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
123 aa  120  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  62.5 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 
124 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
122 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
124 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0440  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
127 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
124 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
121 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  65.29 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
123 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
129 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.48 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>