44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16971 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 90 aa  183  9e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  92.22 
 
 		 90 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  87.64 
 
 		 93 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  70.97 
 
 		 63 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.46 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.74 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  34.15 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.88 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.72 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  29.21 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  35.06 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  35.06 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  34.57 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  39.06 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  29.11 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  31.33 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  27.06 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  27.69 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  32.1 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  28.4 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  28.21 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  26.92 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  29.03 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.88 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  28.57 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  31.17 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  31.65 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  26.67 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  32.14 
 
 		 91 aa  43.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  30.99 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  25.58 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  27.54 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  27.96 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  31.34 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  25.61 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27.96 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>