33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Daud_0010  CDS  NC_010424  10949  11518  570  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001716211  unclonable  5.32264e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0124  CDS  NC_010424  134594  135058  465  GreA/GreB family elongation factor  YP_001716324  unclonable  3.49416e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0125  CDS  NC_010424  135205  136182  978  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_001716325  unclonable  2.98422e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0129  CDS  NC_010424  139194  140309  1116  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  YP_001716329  unclonable  4.45979e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0130  CDS  NC_010424  140486  140977  492  transcription elongation factor GreA  YP_001716330  unclonable  1.29551e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0131  CDS  NC_010424  141002  142474  1473  lysyl-tRNA synthetase  YP_001716331  unclonable  2.75305e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0528  CDS  NC_010424  566044  566928  885  heat shock protein HtpX  YP_001716702  unclonable  1.2228e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0635  CDS  NC_010424  672813  673994  1182  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001716801  unclonable  3.95373e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0636  CDS  NC_010424  674139  674657  519  hypothetical protein  YP_001716802  unclonable  1.12577e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0637  CDS  NC_010424  674658  674837  180  50S ribosomal protein L32  YP_001716803  unclonable  2.15733e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0638  CDS  NC_010424  674940  675947  1008  fatty acid/phospholipid synthesis protein PlsX  YP_001716804  unclonable  3.04584e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0655  CDS  NC_010424  690777  692135  1359  signal recognition particle protein  YP_001716821  unclonable  2.16081e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0702  CDS  NC_010424  736622  736927  306  hypothetical protein  YP_001716864  unclonable  8.42006e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0778  CDS  NC_010424  806444  809536  3093  hypothetical protein  YP_001716932  unclonable  8.07207e-05  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0922  CDS  NC_010424  983717  984181  465  hypothetical protein  YP_001717067  unclonable  3.56631e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1016  CDS  NC_010424  1067535  1068875  1341  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001717160  unclonable  1.61184e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1059  CDS  NC_010424  1115606  1116199  594  superoxide dismutase  YP_001717203  unclonable  3.00614e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1060  CDS  NC_010424  1116716  1116847  132  NifU domain-containing protein  YP_001717204  unclonable  2.36153e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1061  CDS  NC_010424  1117322  1118863  1542  phosphodiesterase  YP_001717205  unclonable  6.0823e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1154  CDS  NC_010424  1209155  1210891  1737  phosphotransferase domain-containing protein  YP_001717297  unclonable  2.51601e-07  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1384  CDS  NC_010424  1465805  1467712  1908  threonyl-tRNA synthetase  YP_001717525  unclonable  7.17334e-07  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1452  CDS  NC_010424  1534979  1535290  312  ribosomal protein L21  YP_001717590  unclonable  5.64167e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1473  CDS  NC_010424  1554215  1556860  2646  valyl-tRNA synthetase  YP_001717611  unclonable  1.4278e-05  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1480  CDS  NC_010424  1564967  1566283  1317  trigger factor  YP_001717618  unclonable  1.82138e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1481  CDS  NC_010424  1566532  1567392  861  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001717619  unclonable  2.20785e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1536  CDS  NC_010424  1620191  1620583  393  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  YP_001717671  unclonable  1.69782e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1537  CDS  NC_010424  1620804  1621667  864  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001717672  unclonable  2.18492e-09  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1538  CDS  NC_010424  1621654  1622028  375  hypothetical protein  YP_001717673  unclonable  2.1378e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2013  CDS  NC_010424  2119128  2119424  297  hypothetical protein  YP_001718136  unclonable  4.48055e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2030  CDS  NC_010424  2137247  2138584  1338  glutamate--ammonia ligase  YP_001718152  unclonable  2.16081e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2031  CDS  NC_010424  2138729  2139325  597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  YP_001718153  unclonable  2.7462e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2205  CDS  NC_010424  2318259  2319611  1353  peptidase M23B  YP_001718324  unclonable  2.18447e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0024  tRNA  NC_010424  1116444  1116531  88  tRNA-Leu    unclonable  1.6794e-11  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>