156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1060 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1060  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 43 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000236153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  84.09 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.74 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  77.27 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  68.29 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  69.77 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  67.44 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  74.42 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.29 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.85 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  65.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  71.43 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2283  NifU domain-containing protein  68.89 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  70.45 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.64 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.91 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.67 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  65.91 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  64.29 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.5 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  58.54 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.09 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  64.29 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  69.05 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.78 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  55.81 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  53.66 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  53.66 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  56.1 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  65.12 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.27 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.9 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.9 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  66.67 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  61.54 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  56.1 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.52 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.49 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  60 
 
 		 298 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.41 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  55 
 
 		 291 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  56.41 
 
 		 331 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  58.97 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.86 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  66.67 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  62.79 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  57.5 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  56.41 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  64.29 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.47 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.85 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.41 
 
 		 329 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  53.85 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  56.41 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.41 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.41 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  53.33 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  53.85 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  51.28 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  46 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  55 
 
 		 289 aa  47.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  51.28 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  56.41 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  48.72 
 
 		 338 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  51.28 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  53.85 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.72 
 
 		 328 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.65 
 
 		 344 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  48.84 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  56.41 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  54.76 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  51.28 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  47.62 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.19 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  48.72 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  48.89 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  48.72 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  48.72 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  43.59 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  46.51 
 
 		 289 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  54.76 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  40.91 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.52 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  54.76 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>