13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0778 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0778  hypothetical protein  100 
 
 
1030 aa  2062    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000807207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0119  hypothetical protein  62.8 
 
 
1026 aa  1187    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3092  hypothetical protein  26.48 
 
 
905 aa  151  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.73 
 
 
941 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  26.7 
 
 
1042 aa  61.6  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  26.29 
 
 
996 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.91 
 
 
865 aa  55.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  28.18 
 
 
218 aa  55.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3181  hypothetical protein  38.39 
 
 
451 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.05 
 
 
1143 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 
778 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  28.4 
 
 
1231 aa  48.5  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  27.54 
 
 
616 aa  45.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>