257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3541 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  289  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  83.78 
 
 		 148 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  77.78 
 
 		 153 aa  229  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  78.77 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  80.58 
 
 		 148 aa  222  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  84.46 
 
 		 148 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  83.11 
 
 		 148 aa  221  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  76.19 
 
 		 148 aa  221  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  75.34 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  78.43 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  76.47 
 
 		 153 aa  193  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  62.84 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  62.84 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  66.22 
 
 		 152 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  66.44 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  65.31 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  64.86 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  66.22 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  68.71 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  67.57 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  65.54 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  65.31 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  63.95 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  63.51 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  64.19 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  64.38 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  55.41 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  54.05 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  54.05 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  55.1 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  64.19 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  64.19 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  57.24 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  56.46 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  58.5 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  52.7 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  54.42 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  52.05 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  53.06 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  52.41 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  53.74 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  53.06 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  52.05 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  53.79 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  52.74 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  52.05 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  51.7 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  48.98 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  48.98 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  52.08 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  51.37 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  50 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  48.63 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  50.68 
 
 		 147 aa  137  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  52.08 
 
 		 148 aa  136  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  48.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  43.84 
 
 		 149 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  43.84 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 149 aa  127  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  45.27 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  45.21 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  51.11 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  45.83 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  43.92 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  45.14 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  45.64 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  47.3 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  44.59 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.45 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  44.3 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  46.36 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.45 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  45.14 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  43.62 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  51.37 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  44.83 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>