86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2236 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  350  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  67.82 
 
 
174 aa  235  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.08475e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002991  hypothetical protein YceD (clustered with ribosomal protein L32p)  65.52 
 
 
174 aa  224  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.52576e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02913  hypothetical protein  64.37 
 
 
174 aa  221  5e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  54.34 
 
 
173 aa  200  1e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  199  2e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.18944e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  199  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23338e-10  hitchhiker  3.03245e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  199  2e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.03492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  199  2e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.84281e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  198  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.85112e-09  hitchhiker  6.61717e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  198  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  54.34 
 
 
173 aa  198  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  197  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.20656e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  2.30682e-13 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  5.2483e-10 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.96903e-06  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  8.50849e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  53.76 
 
 
173 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.45299e-05  hitchhiker  1.56783e-12 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  52.02 
 
 
173 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.57627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  51.45 
 
 
173 aa  191  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.46224e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  52.6 
 
 
173 aa  183  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  8.31476e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  53.18 
 
 
173 aa  182  2e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  51.74 
 
 
174 aa  180  9e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.22055e-08  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  51.74 
 
 
174 aa  180  9e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.25555e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  51.74 
 
 
174 aa  180  9e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.42559e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  54.02 
 
 
174 aa  178  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  50.87 
 
 
173 aa  172  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  8.44005e-11  hitchhiker  6.03572e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  43.93 
 
 
173 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  45.61 
 
 
170 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  40.8 
 
 
175 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  40.23 
 
 
220 aa  135  3e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.24233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  40.23 
 
 
174 aa  133  1e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  9.69755e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  39.08 
 
 
174 aa  131  4e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  39.08 
 
 
174 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  39.08 
 
 
174 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.62111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  129  1e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16707e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  129  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.6877e-07  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  36.78 
 
 
174 aa  128  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.06501e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.29312e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  127  7e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.26789e-08  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  37.36 
 
 
174 aa  127  8e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.83088e-08  hitchhiker  1.64508e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  127  9e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.20152e-09  hitchhiker  3.66748e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  126  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.25431e-07  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  126  1e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.54481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  126  1e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.80096e-08  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  126  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.35289e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  36.21 
 
 
174 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.85744e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  31.79 
 
 
175 aa  84  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  77.8  7e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  32.02 
 
 
178 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  32.02 
 
 
178 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1871  hypothetical protein  32.4 
 
 
185 aa  72.4  3e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  69.7  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  32.07 
 
 
175 aa  67.8  7e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  30.68 
 
 
181 aa  66.6  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  30.23 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  30.48 
 
 
175 aa  65.1  5e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  26.35 
 
 
171 aa  63.9  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  28.4 
 
 
169 aa  62.4  3e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  29.81 
 
 
156 aa  58.9  3e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  30.17 
 
 
174 aa  57  1e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  26.47 
 
 
169 aa  56.2  2e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  26.47 
 
 
169 aa  56.2  2e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  23.67 
 
 
170 aa  55.1  4e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3804  hypothetical protein  31.95 
 
 
175 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1486  hypothetical protein  31.36 
 
 
175 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909701  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1521  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1910  hypothetical protein  31.36 
 
 
175 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  2.22818e-07 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  29.86 
 
 
184 aa  51.2  7e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  30.49 
 
 
178 aa  51.2  7e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  50.4  1e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  30.72 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  30.67 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  30.92 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  30.92 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  31.85 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1643  hypothetical protein  29.59 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17907  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3836  hypothetical protein  29.59 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2888e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  28.93 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4161  hypothetical protein  29.48 
 
 
175 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  32.2 
 
 
201 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  28.92 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  28.46 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1345  hypothetical protein  39.02 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  32.76 
 
 
191 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>