46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002157 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  64.38 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  76.24 
 
 		 101 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  37.2 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  36.07 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  34.96 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  34.25 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  34.23 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  37.31 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  35.24 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  30.77 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  36.63 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  32.7 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  30.35 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  32.24 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  32.24 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  29.05 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  30.14 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  29.56 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  30.95 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  29.73 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  27.23 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  28.37 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  28.37 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  29.11 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.76 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  26.02 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  26.89 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  25.48 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  26.44 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  27.04 
 
 		 672 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  25.12 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.94 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00258  ATPase  83.33 
 
 		 40 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  25.12 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  22.77 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  24.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.6 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  28.12 
 
 		 572 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.49 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  25.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  25.79 
 
 		 652 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  20.49 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  21.52 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  26.34 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  22.17 
 
 		 222 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>