299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0011 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0044  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0022    92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.293323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0019  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572409  normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0058  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647177  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0025  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0021  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA33  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0011  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02876  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313769  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0023  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-His-3  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0022  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.182348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1995  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2495  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.374126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0023  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000286041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0055  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.337308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0247506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0039  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000465225  normal  0.429599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0639484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0008  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.958243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0014  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0018  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901161  normal  0.123364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420238  normal  0.0855626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0789  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1715  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0048  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0372  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1842  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0661069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1828  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0055  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0090  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0004  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000344826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0016  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0043  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4200  tRNA-His  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0024  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0036  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0370477  normal  0.249392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0035  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  85.71 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0046  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0045  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0526  tRNA-His  96.77 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000639476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0020  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0009  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000412211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0002  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0096  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000270279  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0024  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.961461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0088  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0059  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0059  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0582206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0012  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.682919  normal  0.0699826 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  83.33 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  85.29 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0006  tRNA-His  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.0000201498 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0053  tRNA-His  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  83.33 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0045  tRNA-His  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t09  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0116209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t15  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0009  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000796355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R13  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>