12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0053 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0053  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0006  tRNA-His  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.0000201498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0032  tRNA-His  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0836724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0014  tRNA-His  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0346111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0037  tRNA-His  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.28441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>