299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0046 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp01  tRNA-Asp  89.19 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp03  tRNA-Asp  89.19 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  90.77 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt33  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_002950  PGt43  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.022546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0052  tRNA-Asp  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0050  tRNA-Asp  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.0538679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0048  tRNA-Asp  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042005  normal  0.0861498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0046  tRNA-Asp  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445856  hitchhiker  0.00000000718315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0054  tRNA-Asp  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  0.0552316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0019  tRNA-Asp  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000264705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0020  tRNA-Asp  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000252373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp02  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0015  tRNA-Asp  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0036  tRNA-Asp  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000395682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  87.88 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  87.88 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0027  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0006  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000433123  normal  0.0757617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00004  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00065  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0073  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0109  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0303  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0085  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4227  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5085  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.453014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0298  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5008  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0329155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0218  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4106  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0279  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.703656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0228  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4324  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.647358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0200  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0309  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00580589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4121  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4286  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.706333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0292  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  0.882483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0277  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0220  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0230  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4644  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00029583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4708  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.806032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4643  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00729353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0295  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0406525  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0024  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0025  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0290094  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0099  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4129  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.303886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>