299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt33 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt33  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_002950  PGt43  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.022546 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp01  tRNA-Asp  98.61 
 
 		 80 bp  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp03  tRNA-Asp  98.61 
 
 		 80 bp  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0054  tRNA-Asp  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  0.0552316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0052  tRNA-Asp  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0050  tRNA-Asp  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.0538679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0046  tRNA-Asp  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445856  hitchhiker  0.00000000718315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0048  tRNA-Asp  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042005  normal  0.0861498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp02  tRNA-Asp  100 
 
 		 80 bp  125  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  98.48 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  98.48 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  98.48 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  98.48 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0290  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0426135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4227  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0298  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4106  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4121  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0309  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00580589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4286  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.706333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0277  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4178  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0292  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  0.882483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0303  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0284  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.83496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0279  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.703656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0295  tRNA-Asp  98.41 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0406525  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0039  tRNA-Asp  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0017  tRNA-Asp  98.36 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000152694  normal  0.0119772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00003  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.073161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00004  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00065  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0072  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.919613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0073  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0109  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0028  tRNA-Asp  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4643  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00729353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0040  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0013  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1924  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0278323  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0027  tRNA-Asp  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0063  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0470836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0218  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0032  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0093  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0200  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0086  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0085  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0473  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000478831  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4129  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.303886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0126  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0559205  normal  0.0859752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0220  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0288  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.977337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4708  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.806032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4644  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00029583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0062  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.352281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5009  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0039  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5085  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.453014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5008  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0329155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4219  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000946813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0044  tRNA-Asp  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0043  tRNA-Asp  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.502025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0033  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0091  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0100  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0485231  normal  0.35934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0026  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.935679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0228  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5197  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0882882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0025  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0290094  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0024  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0040  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.824145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4324  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.647358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0230  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4197  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0099  tRNA-Asp  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0069  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0063  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748951  normal  0.206184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3115t  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3181t  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07691  tRNA-Asp  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3185t  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.643371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3140t  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0067  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1638  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.27117e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0026  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.472437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>