41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3942 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  40.68 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  40.68 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  40.68 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  39.13 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  36.73 
 
 		 285 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  39.04 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  33.6 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  33.6 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  33.6 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  32.95 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  33.05 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  32.94 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  29.92 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  26.61 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  25.91 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  27.49 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  25.61 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  26.14 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  27.08 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  25.31 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  30.54 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  25.58 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  26.47 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  25.2 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  25.83 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  26.14 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  31.02 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  26.88 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  29.19 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  25.51 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  26.97 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  26.72 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  23.98 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  23.58 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  25.86 
 
 		 268 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>