227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0725 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
86 aa  174  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  57.47 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  61.04 
 
 
85 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  52.33 
 
 
85 aa  100  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  53.49 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  57.95 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  45.98 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  55.06 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  43.68 
 
 
88 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  51.76 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  51.76 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  51.76 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  50.59 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  58.75 
 
 
87 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  51.76 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  49.41 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  85.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  43.56 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  58.75 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  51.76 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  53.16 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  55.13 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  45.24 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  47.56 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  58.49 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  39 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  49.15 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  37.66 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  49.09 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  47.27 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  36.71 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  45.61 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  37.66 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  43.33 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  43.33 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  37.1 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  38.03 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  38.96 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  37.1 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  43.28 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  43.94 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  33.85 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  35.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  35.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  36.67 
 
 
95 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  47.27 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  37.04 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  38.57 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  36.67 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  42.03 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  32.5 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  42.03 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  27.4 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  42.03 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  38.57 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  41.79 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  39.73 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  38.57 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  33.77 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  40.24 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  33.77 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  46.15 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  33.77 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  34.85 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  40.24 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  35.48 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  29.41 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  36.67 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>