39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0019 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  40.37 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  36.8 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  36.48 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  35.85 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  35.9 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  36.44 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  36.48 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  40.3 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  37.66 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  34.46 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  35.19 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  36.48 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  36.89 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  36.89 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  35.27 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  36.88 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  36.12 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  35.97 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  37.18 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  35.95 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  34.59 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  38.46 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  37.92 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  36.29 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  39.93 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  39.93 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  35.12 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  35.2 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  32.92 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  38.18 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  36.03 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  34.92 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  36.48 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  29.05 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  34.51 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>