37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3246 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
358 aa  740  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  56.34 
 
 
368 aa  415  1e-115  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  53.17 
 
 
843 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  48.5 
 
 
383 aa  356  3e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  48.76 
 
 
363 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  50.27 
 
 
377 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  47.09 
 
 
366 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  49.01 
 
 
357 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  44.41 
 
 
364 aa  328  1e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  44.48 
 
 
955 aa  314  2e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  44.07 
 
 
358 aa  311  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  43.42 
 
 
358 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  42.94 
 
 
358 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  43.38 
 
 
358 aa  308  1e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  43.7 
 
 
358 aa  307  2e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  43.94 
 
 
1077 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  44.94 
 
 
787 aa  289  5e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.89 
 
 
734 aa  283  4e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.73 
 
 
734 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  41.13 
 
 
695 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  36.16 
 
 
1082 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  41.1 
 
 
381 aa  274  2e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  43.55 
 
 
317 aa  273  5e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  43.55 
 
 
317 aa  273  5e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  39.94 
 
 
686 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
882 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  36.36 
 
 
361 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  39.28 
 
 
1247 aa  243  4e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.24 
 
 
957 aa  242  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  41.53 
 
 
751 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  41.53 
 
 
751 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  35.45 
 
 
372 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  29.7 
 
 
381 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  29.7 
 
 
381 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.56846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  68.89 
 
 
47 aa  68.6  2e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0540  hypothetical protein  30.43 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  21.66 
 
 
348 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>