37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1467 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  31.74 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  32.03 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  28.74 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  29.78 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  28.9 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  29.48 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  28.9 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  29.1 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  25.88 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  24.09 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  26.52 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  26.45 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  26.19 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  23.63 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  25.3 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  25.17 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  25.16 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  26.19 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  23.26 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>