245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0676 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0971  ribokinase-like domain-containing protein  53.33 
 
 		 318 aa  358  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  46.71 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0099  ribokinase-like domain-containing protein  46.39 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0182  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  30.6 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.89 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.7 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  30.06 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  27.84 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.21 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  28.16 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  27.83 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  28.4 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  28.4 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  27.3 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.25 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  25.89 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  25.89 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  29.12 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.75 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  27.09 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  27.44 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  27.94 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  25.85 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  27.81 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  28.2 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  28.2 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  26.04 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  27.13 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.4 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  28.22 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  29.43 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  27.04 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  25.71 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  26.8 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  26.04 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  25.8 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  26.62 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  25.71 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  26.77 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  24.48 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.4 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  25.94 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  27.94 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  28.17 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  26.71 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  27.82 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1453  1-phosphofructokinase  25.71 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00181905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  27.44 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  25.99 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  25.96 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  26.62 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  23.75 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  27.61 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  28.95 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  26.03 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  25.44 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  25.76 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  26.71 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  27.34 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  25.4 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  26.2 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  26.46 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  23.61 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  25.42 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  25 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  25.55 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  23.34 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  25.08 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  24.57 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  24.57 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.42 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  24.13 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  24.13 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  27.14 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  24.66 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  28.88 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  24.6 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  25 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  23.66 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  25.69 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  26.28 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  26.28 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>