More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1161 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  77.5 
 
 		 245 aa  390  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  72.15 
 
 		 242 aa  355  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  71.19 
 
 		 239 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  68.22 
 
 		 246 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  66.1 
 
 		 243 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  66.95 
 
 		 246 aa  338  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  66.95 
 
 		 242 aa  331  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  66.95 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  65.67 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  65.24 
 
 		 243 aa  320  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  63.29 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  63.4 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  63.4 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  62.04 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  62.03 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  63.25 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  62.98 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  62.82 
 
 		 238 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  61.6 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  61.6 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  60.94 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  62.82 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  62.66 
 
 		 238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  60.43 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.59 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.17 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  61.7 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  62.5 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  61.11 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  62.5 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  62.5 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  60.09 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  60.17 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  60.09 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  58.87 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  61.21 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.43 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  60.09 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  59.66 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  59.66 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  59.66 
 
 		 251 aa  297  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.17 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.34 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  58.44 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  59.17 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  58.44 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  61.64 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.68 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.87 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  61.09 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.39 
 
 		 237 aa  294  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  60.34 
 
 		 236 aa  294  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  59.34 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  60.34 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.72 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  58.92 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.87 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  59.05 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  59.4 
 
 		 236 aa  292  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.23 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  60.26 
 
 		 236 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  59.41 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  55.98 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  58.95 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  57.87 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  58.4 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.47 
 
 		 237 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  58.8 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  59.31 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  57.14 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  58.97 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  58.12 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  57.92 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  57.26 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  57.26 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  57.26 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56.22 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  56.85 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  57.76 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  57.92 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  59.05 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  57.94 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.28 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  57.08 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.45 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  57.74 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  59.15 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  57.74 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  57.74 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  57.58 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  57.74 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>