More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2190 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 
443 aa  880    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  70.55 
 
 
450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  59.27 
 
 
471 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  61.56 
 
 
440 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  59.73 
 
 
460 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  59.73 
 
 
447 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  56.5 
 
 
515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  56.26 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  56.21 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  58.53 
 
 
468 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  56.29 
 
 
461 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  57.86 
 
 
444 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  54.67 
 
 
466 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  54.63 
 
 
444 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  55.74 
 
 
526 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  58.64 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  54.8 
 
 
515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  52.69 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  54.33 
 
 
468 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  52.09 
 
 
508 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  49.54 
 
 
464 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  49.43 
 
 
452 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  50.67 
 
 
487 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  54.34 
 
 
445 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  52.98 
 
 
471 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  50.11 
 
 
452 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  49.66 
 
 
462 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  50.33 
 
 
477 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  51.12 
 
 
448 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.2 
 
 
517 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  53.69 
 
 
471 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  53.38 
 
 
467 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  46.78 
 
 
543 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  53.15 
 
 
467 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  53.15 
 
 
467 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  47.1 
 
 
485 aa  348  1e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  53.35 
 
 
471 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  42.13 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  43.49 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.17 
 
 
443 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.05 
 
 
440 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.25 
 
 
431 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.68 
 
 
429 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 
434 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  36.2 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.96 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.03 
 
 
424 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  35.39 
 
 
438 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 
424 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.17 
 
 
424 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.79 
 
 
435 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.99 
 
 
437 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 
426 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 
424 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
425 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.79 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  39.72 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.16 
 
 
433 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  38.76 
 
 
425 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 
431 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.13 
 
 
416 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.36 
 
 
431 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.16 
 
 
433 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
432 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.56 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.56 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  29.93 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  29.93 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  29.93 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.66 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.29 
 
 
441 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 
441 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 
424 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 
441 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  33.51 
 
 
411 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.94 
 
 
414 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.46 
 
 
451 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.39 
 
 
466 aa  193  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  29.86 
 
 
432 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.53 
 
 
433 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  26.62 
 
 
413 aa  192  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  30.12 
 
 
407 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  33.26 
 
 
429 aa  191  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  37.11 
 
 
441 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  38.18 
 
 
878 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 
437 aa  190  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
440 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.72 
 
 
433 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  31.5 
 
 
431 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 
436 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  36.06 
 
 
422 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.81 
 
 
431 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 
435 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 
404 aa  186  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  33.73 
 
 
810 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>