More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1209 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  100 
 
 		 476 aa  900    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  52.84 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.21 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  41.72 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  44.88 
 
 		 444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  45.65 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  43.69 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  43.9 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  47.07 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  45.15 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 		 461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  41.43 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  43.18 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  44.47 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  42.51 
 
 		 515 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.51 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  41.06 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  39.4 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  39.51 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.23 
 
 		 464 aa  252  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  36.74 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  38.5 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  41.08 
 
 		 445 aa  239  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.5 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  38.92 
 
 		 526 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  40.95 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  40.56 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  41.79 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  40.69 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  40.69 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  40.48 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  38.44 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  37.72 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.04 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  32.98 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  32.97 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  27.97 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  34.81 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  28.05 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  28.48 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  24.55 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  23.65 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  28.61 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  31.02 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  26.9 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  26.9 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  25.97 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  21.57 
 
 		 433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  30.03 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  25.39 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  23.87 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  28.11 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  28.47 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  22.93 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  22.93 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  22.93 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  22.93 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  20.9 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  24.45 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  22.93 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  24.52 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.54 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  29.32 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  31.73 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  22.61 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  27.7 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  22.96 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  32.45 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  28.02 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  21.44 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  29.4 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  24.93 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  31.65 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  21.97 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  22.39 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  26.09 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  26.09 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  23.84 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  30.21 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  30.98 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.23 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  27.34 
 
 		 424 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  30.98 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  28.34 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  30.6 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  28.66 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  25 
 
 		 457 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  24.34 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  20.27 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  30.28 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  29.86 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.55 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.35 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>