More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0043 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  82.82 
 
 		 424 aa  679    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  100 
 
 		 423 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  87.47 
 
 		 423 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  82.27 
 
 		 422 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  75.89 
 
 		 422 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  82.12 
 
 		 424 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  75.24 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  73.78 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  72.58 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  71.63 
 
 		 421 aa  594  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  74.23 
 
 		 421 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  73.76 
 
 		 421 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  71.16 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  69.27 
 
 		 421 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  71.16 
 
 		 421 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  69.27 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  69.27 
 
 		 421 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  69.27 
 
 		 421 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  67.43 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  71.16 
 
 		 421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  69.5 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  73.29 
 
 		 422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  73.52 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  68.32 
 
 		 421 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  68.79 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  65.75 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  68.09 
 
 		 421 aa  557  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  67.61 
 
 		 420 aa  551  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  69.56 
 
 		 452 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  69.32 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  65.41 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  68.79 
 
 		 421 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  66.51 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02610  aspartate kinase  62.47 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28320  aspartate kinase  59.87 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  58.54 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  56.86 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  52.63 
 
 		 412 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  52.67 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19620  aspartate kinase  51.92 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  51.94 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  50.24 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  51.72 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  51.33 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  51.09 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  51.94 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  49.51 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  49.76 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  49.76 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  50.61 
 
 		 409 aa  401  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  50.73 
 
 		 412 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  51.22 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  51.94 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  50.25 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  49.76 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  49.76 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  49.51 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  50.73 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  50.85 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  49.88 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  49.52 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  56.48 
 
 		 415 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  55.53 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  50.37 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  52.32 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  46.84 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  53.2 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  50.36 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  48.18 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  51.72 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  48.53 
 
 		 405 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  48.66 
 
 		 413 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  49.88 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  51.1 
 
 		 409 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  50 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  46.99 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  48.77 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  46.53 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  48.53 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  49.03 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  50.12 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  52.21 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  50.86 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  49.88 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  48.43 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  49.75 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  50 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  47.71 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  48.53 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  50.61 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  47.09 
 
 		 599 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  50.61 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  48.04 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  48.31 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1711  aspartate kinase  48.18 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  46.21 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.79 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  48.04 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  50.12 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  50.49 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>