26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3513 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2878  hypothetical protein  39.74 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2908  hypothetical protein  39.74 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321765  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2922  hypothetical protein  39.74 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  37.75 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  38.97 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  34.04 
 
 
450 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  35 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  34.09 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  34.27 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.35 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  28.47 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  36.5 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  34.35 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.99 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.53 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  29.23 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  25.95 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  27.21 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  31.47 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  33.08 
 
 
168 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  28.79 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  28.79 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  29.25 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.54 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>