38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0097 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0097  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
529 aa  999  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4337  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
467 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848545  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2119  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
386 aa  61.2  5e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
450 aa  56.2  1e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6615  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
447 aa  53.1  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251672  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  28.93 
 
 
411 aa  50.8  5e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  34.4 
 
 
586 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
441 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.37 
 
 
420 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  30 
 
 
412 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.89 
 
 
420 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
407 aa  47.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
411 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
426 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.43 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.34 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3065  major facilitator transporter  35.75 
 
 
402 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  4.80105e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
456 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  25.6 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6165  hypothetical protein  53.19 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  hitchhiker  0.00553509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  33.73 
 
 
419 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
476 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0385  hypothetical protein  32.87 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  29.07 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  32.26 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
426 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  33.33 
 
 
418 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  33.33 
 
 
418 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.06 
 
 
405 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.06 
 
 
405 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  36.64 
 
 
536 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  30 
 
 
414 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.38 
 
 
431 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  33.33 
 
 
418 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>