23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2662 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  971  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  66.12 
 
 
477 aa  583  1e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  32.72 
 
 
518 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  31.82 
 
 
545 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  32.02 
 
 
556 aa  199  1e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 
439 aa  85.1  3e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  26.77 
 
 
475 aa  76.6  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.69 
 
 
565 aa  75.5  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  30.39 
 
 
473 aa  64.3  4e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  28.38 
 
 
450 aa  63.9  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  28.27 
 
 
442 aa  62  2e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  25.06 
 
 
505 aa  60.1  8e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  30.37 
 
 
339 aa  57  6e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  26.47 
 
 
455 aa  57  7e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  31.37 
 
 
316 aa  54.7  4e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.22 
 
 
443 aa  54.7  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  29.28 
 
 
487 aa  50.4  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  30.22 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  25.16 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  27.83 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  24.84 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  29.48 
 
 
444 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>