More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0969 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  72.97 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  68.75 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  66.07 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  71.17 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  61.61 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  58.04 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.04 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  56.25 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  58.33 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>