60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2356 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  39.87 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  37.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  35.76 
 
 		 177 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  34.81 
 
 		 175 aa  88.2  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  33.1 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  33.1 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  32.41 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  34.72 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  42.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  32.59 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  32.5 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  32.59 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  35.16 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  35.61 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  41.1 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  41.1 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  36.09 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  36.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  36.23 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  38.32 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  30 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1086  17 kDa surface antigen  36.96 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  29.94 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  29.63 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  35.98 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  28.89 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  35.2 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  32.35 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  38.03 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  41.46 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  41.03 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  41.03 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  34.92 
 
 		 376 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  40.38 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  35.4 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>