More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1485 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  80.49 
 
 		 84 aa  140  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  74.71 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  75.61 
 
 		 84 aa  133  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  63.1 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  56.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0969  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_842  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00265541  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  51.69 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>