More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2132 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  46.54 
 
 
263 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.5 
 
 
276 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
453 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.42 
 
 
284 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.85 
 
 
273 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 
440 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.32 
 
 
281 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 
276 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.56 
 
 
398 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 
271 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
456 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 
403 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.56 
 
 
285 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
288 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
285 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.94 
 
 
395 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  41.45 
 
 
240 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.54 
 
 
252 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
266 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  38.14 
 
 
239 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
283 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.78 
 
 
291 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  36.43 
 
 
280 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
270 aa  185  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 
284 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  39 
 
 
605 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37 
 
 
403 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
249 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.08 
 
 
255 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
541 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.09 
 
 
310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  38.98 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 
277 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
254 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  40.17 
 
 
255 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  40.17 
 
 
255 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  38.11 
 
 
380 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 
411 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  36.63 
 
 
288 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
249 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 
285 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
281 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  35.56 
 
 
282 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.49 
 
 
290 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.4 
 
 
277 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
255 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  35.42 
 
 
283 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.71 
 
 
256 aa  174  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  39.74 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
568 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.59 
 
 
257 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  37.61 
 
 
325 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
271 aa  168  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.91 
 
 
259 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.79 
 
 
286 aa  168  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  36.32 
 
 
246 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  37.75 
 
 
286 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.89 
 
 
285 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  35.89 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.54 
 
 
274 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.75 
 
 
243 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  36 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
258 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 
244 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  36.44 
 
 
277 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.57 
 
 
288 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
255 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.32 
 
 
541 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 
252 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.71 
 
 
305 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  36.41 
 
 
247 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  36.41 
 
 
247 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.57 
 
 
280 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  36.41 
 
 
251 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  36.21 
 
 
291 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 
293 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>