48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13509 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  338  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  40.65 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.5 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  35.83 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  34.71 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1719  hypothetical protein  29.73 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  32.03 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  31.11 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  32.17 
 
 
139 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.75 
 
 
137 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  31.15 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  31.97 
 
 
163 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.71 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0825  hypothetical protein  32.8 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.149035  unclonable  0.00000927167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  33.04 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  36.54 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  33.77 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  30.3 
 
 
358 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.25 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  28.45 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  32.17 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.85 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  32.17 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  32.17 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1101  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.76 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.699365  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  29.75 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  25.68 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  28.45 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  30.94 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  27.45 
 
 
183 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.91 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  27.14 
 
 
183 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>