35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12591 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  40.34 
 
 
371 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  32.7 
 
 
388 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  36.87 
 
 
431 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  40.13 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  37.82 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  27.24 
 
 
365 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  36.26 
 
 
379 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  29.45 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  35.42 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  29.52 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  29.75 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  33.53 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  27.04 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  28.63 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  32.05 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  30.74 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  34.67 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  28.1 
 
 
432 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  26.2 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  30.25 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.94 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  59.3  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  59.3  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  32.39 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  25.26 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  29.28 
 
 
389 aa  53.1  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  26.99 
 
 
415 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  27.07 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  26.67 
 
 
776 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  29.5 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  24.46 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  24.77 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>