37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1438 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  100 
 
 
378 aa  776    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  33.9 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  30.32 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  32.78 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  32.22 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  27.52 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  32.22 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  31.58 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  27.1 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  30.57 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  27.45 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  21.48 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  21.48 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  24.74 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  24.74 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  25.6 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2537  integral membrane protein  25.6 
 
 
351 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000042014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  22.12 
 
 
328 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2797  hypothetical protein  23.95 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2776  hypothetical protein  24.68 
 
 
275 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  29.14 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  31.01 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  31.03 
 
 
361 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  25 
 
 
432 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.31 
 
 
477 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>