More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1689 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  100 
 
 
320 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  60.19 
 
 
327 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  59.82 
 
 
321 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  57.42 
 
 
321 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  57.42 
 
 
321 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 
325 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  35.57 
 
 
286 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  35.69 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  35.84 
 
 
286 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 
291 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  35.82 
 
 
282 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
320 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  34.39 
 
 
281 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  32.55 
 
 
288 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  33.92 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 
281 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  32.42 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  32.63 
 
 
284 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  32.17 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  32.17 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  32.28 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.01 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.71 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
340 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  30.66 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  30.42 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  31.82 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.91 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  31.82 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
293 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  30.66 
 
 
286 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  30.82 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  30.18 
 
 
287 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
281 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 
291 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 
285 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
297 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  31.41 
 
 
647 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
281 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
281 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  30.66 
 
 
308 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  30.87 
 
 
280 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.14 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  31.62 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  31.9 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
277 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  30.79 
 
 
281 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  29.93 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.21 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.21 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.21 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.82 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
281 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  30.24 
 
 
279 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  31.6 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  31.06 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.82 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  29.63 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  28.62 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  30.07 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  30.9 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 
333 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 
282 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.68 
 
 
277 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  29.62 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
280 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.87 
 
 
281 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
280 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.07 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.07 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  27.99 
 
 
282 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.23 
 
 
289 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
281 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
282 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>