More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2557 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  100 
 
 
324 aa  642  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  88.27 
 
 
328 aa  570  1e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  74.38 
 
 
331 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  68.52 
 
 
332 aa  464  1e-130  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  68.21 
 
 
332 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  64.09 
 
 
329 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  64.4 
 
 
329 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  64.51 
 
 
329 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  66.46 
 
 
328 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
333 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  62.85 
 
 
330 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  61.59 
 
 
336 aa  405  1e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  63.58 
 
 
326 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  62.96 
 
 
325 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  61.49 
 
 
326 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  58.13 
 
 
324 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  51.74 
 
 
331 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  50.47 
 
 
331 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  49.54 
 
 
329 aa  356  3e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  51.42 
 
 
331 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 
334 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 
334 aa  337  2e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  53.96 
 
 
334 aa  336  4e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  52.96 
 
 
337 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  2.64016e-07 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
326 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  52.76 
 
 
332 aa  312  6e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
323 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  49.54 
 
 
324 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.91335e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
331 aa  302  6e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  43.3 
 
 
324 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  45.02 
 
 
332 aa  282  6e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  46.44 
 
 
335 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
338 aa  273  2e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  2.58754e-07 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
337 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  38.79 
 
 
337 aa  271  8e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 
337 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
337 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
337 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  39.32 
 
 
336 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  38.04 
 
 
329 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
334 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  37.58 
 
 
334 aa  259  5e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
322 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  36.73 
 
 
336 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36.31 
 
 
329 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  40.31 
 
 
328 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
341 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
318 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
341 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
330 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  37.31 
 
 
324 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  49.44 
 
 
333 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  39.02 
 
 
333 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  40 
 
 
333 aa  236  5e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  41.85 
 
 
324 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  38.72 
 
 
324 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
330 aa  234  2e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  34.16 
 
 
328 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  32.82 
 
 
342 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
328 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  39.63 
 
 
328 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
343 aa  229  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  46.92 
 
 
331 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  41.88 
 
 
320 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
261 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  45.76 
 
 
317 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
321 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  42.98 
 
 
265 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.37492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
318 aa  218  8e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  48 
 
 
276 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
254 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  47.39 
 
 
285 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  47.97 
 
 
292 aa  213  3e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.48 
 
 
341 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  40.2 
 
 
323 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.05 
 
 
342 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  44.96 
 
 
326 aa  199  4e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  31.21 
 
 
339 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  33.21 
 
 
314 aa  189  6e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  1.4489e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
329 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  36.25 
 
 
302 aa  175  1e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.58 
 
 
314 aa  174  3e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  31.75 
 
 
262 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.37 
 
 
316 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  34.33 
 
 
332 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  41.7 
 
 
339 aa  156  5e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.2 
 
 
317 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  2.25656e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  30.61 
 
 
327 aa  154  3e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
330 aa  153  3e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 
312 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.8 
 
 
305 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  38.68 
 
 
581 aa  152  6e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  39.39 
 
 
339 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>